Thauvin a joué pour plusieurs clubs tout au long de sa carrière :

- SC Bastia (2011-2013) : Début professionnel

- Olympique de Marseille (2013-2017, 2018-2021) : Vainqueur de la Ligue Europa

- Newcastle United (prêt, 2015-2016)

- Tigres UANL (2021-2023) : Champion du Mexique

- UD Almería (depuis 2023) : En La Liga espagnole

Il a contribué à des titres majeurs, dont la Ligue 1 avec Marseille.